曝Tome Biosciences陷入困境，張鋒學(xué)生創(chuàng )辦，9個(gè)月前完成超2億美元融資

據多位知情人士透露，基因編輯初創(chuàng )公司 Tome Biosciences 正在陷入困境，即使該公司在 9 個(gè)月前剛完成 2.13 億美元融資。

據美國健康醫療專(zhuān)業(yè)媒體 STAT 報道，Tome 將全面停止運營(yíng)，并在 11 月 1 日前尋找買(mǎi)家。但另一位消息人士稱(chēng)，仍有一些選擇可以讓這家生物技術(shù)公司繼續運營(yíng)。兩位消息人士均要求匿名。

Tome 發(fā)言人在一封電子郵件中告訴媒體 Fierce Biotech：“盡管我們在科學(xué)上取得了明顯的進(jìn)步，但投資者對基因編輯領(lǐng)域的情緒發(fā)生了巨大變化，尤其是對臨床前的公司而言。鑒于此，公司正在降低產(chǎn)能，保持核心專(zhuān)業(yè)知識，我們正在與多方進(jìn)行保密對話(huà)，以探索戰略選擇。”

該公司沒(méi)有回答有多少員工會(huì )受到這些變化的影響。此外，Tome 的產(chǎn)品線(xiàn)可能發(fā)生變化的細節也沒(méi)有披露。

Tome Biosciences 的兩位創(chuàng )始人 Jonathan Gootenberg 和Omar Abudayyeh 都是張鋒的學(xué)生。2020 年，兩位開(kāi)發(fā)出了一種基因編輯工具，可以將大型 DNA 序列插入基因組中的精確位置，同時(shí)降低脫靶風(fēng)險。

Gootenberg 和 Abudayyeh 于 2019 年首次構思了這種方法，當時(shí)他們都是麻省理工學(xué)院的麥戈文研究員，兩人合作共同發(fā)表了多篇文章。

他們的首要目標之一是將大型 DNA 序列精確地遞送到基因組中的特定位置，同時(shí)避免對細胞造成損害。他們在使用原始的 CRISPR-Cas9 系統進(jìn)行基因組編輯時(shí)發(fā)現存在缺點(diǎn)，即只有在 DNA 雙螺旋斷裂后，目標序列才會(huì )暴露出來(lái)以供操作。雙鏈 DNA 斷裂會(huì )帶來(lái)多種風(fēng)險，包括可能造成意外的基因修飾和導致細胞死亡。

因此，兩位研究人員嘗試了其他方法，并及時(shí)找到了解決方案：他們沒(méi)有剪斷雙螺旋的兩條鏈，而是采用了一種基于 CRISPR-Cas9 的新型系統，該系統在基因組的特定點(diǎn)產(chǎn)生單鏈 DNA 斷裂。然后利用生化過(guò)程整合 DNA 有效載荷并修復斷裂的鏈，從而實(shí)現精確的基因插入。

2022 年，兩位發(fā)表論文，描述了使用被稱(chēng)之為 PASTE（Programmable Addition via Site-specific Targeting Elements）的方法成功地將長(cháng)達 36,000 個(gè)堿基對的序列遞送到人類(lèi)和其他細胞類(lèi)型中。

在改進(jìn) PASTE 的同時(shí)，Gootenberg 和 Abudayyeh 著(zhù)手創(chuàng )建了 Tome。包括 a16z、ARCH Venture Partners 和 GV 等資本均參與其中。2023 年 12 月，Tome 以 2.13 億美元融資（A 輪 + B 輪）走出隱匿模式，其使命是“譜寫(xiě)基因組編輯的最后一章”。

Tome 公司表示，其可編程基因組整合（PGI）平臺旨在將任何大小的 DNA 序列插入到任何編程的基因組位點(diǎn)，PGI 平臺包括一系列基因組編輯方法，每種方法都代表了對 PASTE 技術(shù)的優(yōu)化升級。PGI 是一個(gè)強大且靈活的技術(shù)平臺，釋放了基因組工程的全部潛力，代表了基因組醫學(xué)的最終章。

目前，Tome 正在開(kāi)發(fā)兩種 PGI 技術(shù)：整合酶介導的 PGI (I-PGI) 和連接酶介導的 PGI (L-PGI)。

在咨詢(xún)了學(xué)術(shù)專(zhuān)家后，Tome 決定專(zhuān)注于單基因肝病的基因治療和自身免疫性疾病的細胞治療。

該公司通過(guò)多種方式解決基因組編輯問(wèn)題：一種是 PASTE 的工業(yè)化版本，它依靠整合酶插入有效載荷，另一種則由 Tome 以 6500 萬(wàn)美元收購的 DNA 編輯公司 Replace Therapeutics 推動(dòng)，這筆交易價(jià)值高達 1.85 億美元，使 Tome 能夠使用后者的連接酶介導技術(shù)。

收購約兩周后，Tome 與專(zhuān)注于 RNA 的 Genevant Sciences 達成了一項罕見(jiàn)肝病交易。Tome 向 Genevant 提供了高達 1.14 億美元的生物資金，結合雙方的 PGI 平臺與脂質(zhì)納米顆粒技術(shù)，希望開(kāi)發(fā)一種針對單基因肝病的體內基因編輯療法。

Tome 還在 5 月份的美國基因與細胞治療學(xué)會(huì )年會(huì )上分享了臨床前數據。正是在這次會(huì )議上，Tome 透露了其主要項目是苯丙酮尿癥的基因療法和腎臟自身免疫性疾病的細胞療法。

（來(lái)源：Tome Biosciences）

目前，官網(wǎng)顯示，Tome 涉及到的適應癥包括苯丙酮尿癥、動(dòng)脈粥樣硬化性心血管疾病、同型胱氨酸尿癥、遺傳性血色素沉著(zhù)癥、B 細胞驅動(dòng)的自身免疫性疾病。

在同一場(chǎng)會(huì )議上，劉如謙也介紹了其在基因組編輯領(lǐng)域的新成果，同樣在不產(chǎn)生 DNA 雙鏈斷裂的情況下，在人類(lèi)細胞中實(shí)現大基因的高效、位點(diǎn)特異性整合。

該研究利用噬菌體輔助連續進(jìn)化（PACE）技術(shù)，將絲氨酸整合酶 Bxb1 迭代進(jìn)化了數百代，克服了 PASSIGE 技術(shù)效率低的問(wèn)題，可對長(cháng)達 10 kb 的大片段 DNA 實(shí)現高水平整合（效率可達 35%），相比 PASTE 技術(shù)，將大片段 DNA 的位點(diǎn)特異性整合效率提高了一個(gè)數量級。

埃默里大學(xué)和佐治亞理工學(xué)院的生物醫學(xué)工程教授 Philip Santangelo 曾認為 Tome 的方法創(chuàng )新且令人興奮。但 Santangelo 表示，與基因組編輯領(lǐng)域的其他公司一樣，Tome 也面臨著(zhù)復雜的交付挑戰，并且需要證明其安全性和有效性。Tome 的科學(xué)委員會(huì )成員表示還需要證明其能夠調節拷貝數表達?！癋DA 希望知道細胞內特定基因表達的拷貝數，因為過(guò)度表達可能導致腫瘤和其他安全問(wèn)題?！?/span>

另外，摩根大通 7 月份的一份報告顯示，各大制藥公司已將許可工作轉向后期資產(chǎn)，尤其注重基于抗體的療法和抗體-藥物偶聯(lián)物，而細胞和基因治療合作伙伴關(guān)系的總價(jià)值則有所下降；PitchBook 的數據顯示，細胞和基因治療領(lǐng)域的投資最近有所放緩，領(lǐng)先生物技術(shù)的資產(chǎn)需要更多時(shí)間來(lái)推進(jìn)。